Jakość wody mały|240x240px|Zeutrofizowane koryto Średzkiej Wody w pobliżu Chomiąży mały|240x240px|Koryto Średzkiej Wody i wały przeciwpowodziowe w jej odcinku ujściowym Głównymi źródłami zanieczyszczeń wód powierzchniowych w zlewni Średzkiej Wody są: Oczyszczalnia ścieków w Środzie Śląskiej należąca do "Średzka Woda" Sp. z o.o., zrzucająca do Średzkiej Wody oczyszczone ścieki metodą mechaniczno-biologiczną w ilości 2640 m³/d Oczyszczalnia typu „Bioblok” spółdzielni mieszkaniowej „Na Skarpie” w Ciechowie, zrzucająca oczyszczone ścieki w ilości 85,1 m³/d Oczyszczalnia ścieków w Miękini, zrzucająca oczyszczone metodą mechaniczno-biologiczną ścieki w ilości 84 m³/d Osiedle mieszkaniowe dawnego PGR w miejscowości Proszków, odprowadzające 8,6 m³/d oczyszczonych ścieków. Wg Państwowego Inspektoratu Ochrony Środowiska we Wrocławiu Średzka Woda na ujściu do Odry charakteryzowała się następującymi parametrami i wskaźnikami jakości w poszczególnych latach: RokElementy fizykochemiczne (klasa)Elementy biologiczne (klasa)Elementy hydromorfologiczne (klasa)Stan/potencjał ekologicznySTAN2004IIInie badanonie badanonie określononie określono2005IVnie badanonie badanonie określononie określono2007IVnie badanonie badanonie określononie określono2008IIInie badanonie badanonie określononie określono2011IIIIInie badanonie określononie