Natomiast w przypadku płytko zalegających aquiferów ich górną granicę stanowić może powierzchnia ziemi lub też powierzchnia freatyczna.
Aquifery zasilane są w sposób naturalny poprzez dopływy wód podziemnych, lub też wód powierzchniowych (opady atmosferyczne, przecieki z rzek i jezior). Naturalne opróżnianie aquiferów następuje poprzez źródła powierzchniowe lub odpływy podziemne. Aquifery mogą też być zasilane lub częściowo opróżniane w sposób sztuczny poprzez systemy studzien i odwiertów.
Objętość wody zawartej w aquiferze wyraża się wzorem:
gdzie jest lokalną porowatością warstwy porowatej w punkcie o współrzędnych a całkowanie rozciąga się na cały obszar tej warstwy Niekiedy, zwłaszcza w aquiferach o większym ciśnieniu złożowym zachodzi konieczność modyfikacji powyższej formuły poprzez wprowadzenie współczynnika objętościowego (ang. bulk volume factor).
Ruchy wód złożowych w aquiferach mają zazwyczaj charakter przepływów poziomych. Powszechnie przyjmuje się, że podlegają one formule Darcy’ego wiążącej w sposób liniowy prędkość filtracji z gradientem ciśnienia.