W październiku 2009 rząd wyznaczył nowy termin wyborów na 6 grudnia 2009, z drugą tura głosowania w dniu 20 grudnia. 14 listopada 2009 rozpoczęła się kampania wyborcza, która trwała do 4 grudnia 2009. Kampania przed II turą trwała od 13 do 18 grudnia 2009. W czasie głosowania obywatele wybierali 24 deputowanych do 33-osobowego Zgromadzenia Federalnego w oparciu o zasady ordynacji większościowej. Pozostałych 9 deputowanych delegowanych jest przez władze regionalne 3 wysp. Do udziału w wyborach zarejestrowało się ponad 360 tys. obywateli.
Kampania wyborcza W czasie kampanii wyborczej kandydaci koalicji prezydenckiej zapowiadali kontynuację stabilizacji gospodarczej kraju. Podkreślali dotychczasowe sukcesy administracji prezydenta Sambiego, w tym zmniejszenie pensji urzędników państwowych, zwiększenie wpływów podatkowych, wzmocnienie prywatnego sektora gospodarki, a także względny pokój w kraju po stłumieniu rebelii na wyspie Anjouan w 2008. Opozycja oskarżała rządzących o naruszenia wolności politycznych, porażkę w walce z korupcją oraz zamiar umacniania swojej władzy.