Był konsultantem filmu Prymas. Trzy lata z tysiąca, w którym jego postać zagrał Zbigniew Zamachowski. W pracy duszpasterskiej Skorodecki zajmował się głównie wychowaniem młodzieży – z grona jego uczniów ponad 150 zostało kapłanami. Zmarł tragicznie w wodach Bałtyku 31 lipca 2002 r. Pogrzeb odbył się w Ropczycach, gdzie spoczął na miejscowym cmentarzu parafialnym.
W 1999 został honorowym obywatelem Lubaczowa.
Kontrowersje Prokuratura nie znalazła podłoża przestępczego w okolicznościach jego śmierci. Śmierć Skorodeckiego nastąpiła dwa dni po ukazaniu się w tygodniku „NIE” artykułu oskarżającego go o pedofilię. Zarzuty o molestowanie potwierdził również na bazie własnych osobistych doświadczeń z księdzem prof. Stanisław Obirek. Nazwał go nawet „drapieżcą”, a jego śmierć w wodach Bałtyku uznał za karę boską.
Niektórzy historycy twierdzą, że Skorodecki był konfidentem Urzędu Bezpieczeństwa, w okresie wspólnego uwięzienia z prymasem WyszyńskimInformację, iż Skorodecki był agentem specjalnie osadzonym z Wyszyńskim, zamieścił także prof. Wiesław Władyka w swojej książce „Osaczony Prymas”.. Zdaniem historyk Ewy Czaczkowskiej, w IPN znajduje się 10 tomów jego donosów na prymasa Stefana Wyszyńskiego.