Gra rozpoczyna się w 1922 roku, gdzie Indy i Magnus poszukują dla Kingstona tajemniczej Nefrytowej Sfery (w innych wersjach Kingston sam znalazł Sferę). Pominięto rozdział w Sudanie. Kiedy Indy przyjeżdża do San Francisco, oboje Archie i Suzie są w niewoli u Tongów. Indy sam znajduje wskazówki dotyczące tego, gdzie są przetrzymywani. Nefrytowa Sfera jest ukryta na przedmieściach San Francisco, a nie w Gwieździe Orientu (statek ten zupełnie nie występuje w tej wersji). Sfera zostaje odebrana Jonesowi na początku rozdziału w Panamie przez Sudao. Indy musi więc najpierw odzyskać kulę, a dopiero potem utorować sobie drogę do Panamskiej Świątyni (zwanej tutaj Świątynią Kosmosu). Podobnie jak w wersji Wii/PS2, „Pasterz” jest ukryty w Pałacu Tokapi'ego, jednakże w zupełnie innej części, wybudowanej w stylu romańskim. Ponadto Indy musi najpierw znaleźć Kroniki Pasterza, które doprowadzą go do miejsca jego ukrycia. Wioska u podnóża Świątyni Berła jest tutaj nazwana Suya Desh. Pod koniec gry Indiana zatapia Odina wraz z Magnusem na pokładzie za pomocą Laski Mojżesza.
Przypisy