11 stycznia 2019 McCarrick został poinformowany o decyzji wydalenia ze stanu duchownego, jednak skorzystał ze swojego prawa i ją zaskarżył.
13 lutego 2019 jego odwołanie zostało odrzucone i na mocy decyzji Kongregacji Nauki Wiary, która uznała go za winnego molestowania seksualnego małoletnich i dorosłych, został wydalony ze stanu kapłańskiego, o czym został poinformowany 15 lutego. Papież Franciszek decyzję Kongregacji określił jako ostateczną (res iudicata).
Sekretariat Stanu Stolicy Apostolskiej na życzenie papieża Franciszka sporządził i 10 listopada 2020 opublikował „Raport na temat instytucjonalnego dochodzenia i procesu decyzyjnego Stolicy Apostolskiej dotyczącego byłego kardynała Theodore’a Edgara McCarricka (od 1930 do 2017)”. Celem raportu ma być prześledzenie awansu McCarricka w strukturach Kościoła pomimo trwającego przez wiele lat molestowania małoletnich.
Były kardynał stawił się w sądzie 3 września 2021 roku. Podczas rozprawy usłyszał zarzuty w sprawie trzech przypadków nadużyć wobec 14-letniego chłopca, których miał dopuścić się w latach 70. Za każdy grozi mu 5 lat więzienia.