28 grudnia 2023 ukończył 80 lat, tracąc prawo do udziału w konklawe.
Kontrowersje Kardynał Juan Luis Cipriani był zaangażowany w kilka kontrowersji podczas swojej kadencji. Znany peruwiański dziennikarz Jaime Bayly oskarżył Ciprianiego o udział w przypadkach wykorzystywania seksualnego dzieci w Kościele oraz o tuszowanie tych przypadków. W artykule opublikowanym w Peru21, Bayly szczegółowo opisał swoje zarzuty wobec Ciprianiego, podkreślając, że jego działania były szkodliwe i nieodpowiednie..
Środki dyscyplinarne nałożone na kardynała istnieją i są nadal ważne i obowiązujące, co potwierdził 26 stycznia 2025 roku dyrektor Biura Prasowego Stolicy Apostolskiej, Matteo Bruni. Odniósł się w tu do doniesień hiszpańskiej prasy o zarzutach przeciwko kardynałowi w 2018, odnoszących się do nadużyć, których Cipriani rzekomo dopuścił się na początku lat 80. Zarzuty te doprowadziły do szeregu sankcji, w tym obowiązku opuszczenia ojczyzny.