Świątynia zaczęła podnosić się z ruiny prawdopodobnie zaraz po opuszczeniu miasta przez Szwedów, ale nową księgę parafialną, świadczącą o udzielaniu sakramentów założono dopiero w 1662 r. Odbudowa świątyni z uwagi na ogrom zniszczeń trwała długo i była prowadzona dzięki staraniom proboszcza Jana Kopciowicza. Dwa ołtarze konsekrowano już w 1662 roku, ale cały, wzniesiony niemal od nowa kościół konsekrował biskup Mikołaj Oborski dopiero w 1682 r.
Wspólnoty parafialne Służba liturgiczna Parafialny Zespół Charytatywny Stowarzyszenie Rodzin Katolickich Akcja Katolicka Katolickie Stowarzyszenie Pielęgniarek i Położnych Duszpasterstwo Młodzieży
Zasięg parafii Do parafii należą wierni mieszkający w Krakowie przy ulicy: Ariańskiej, Blachnickiego, Blich, Bonerowskiej, Bosackiej, Botanicznej, Bujwida, Chodkiewicza, Curie-Skłodowskiej nry nieparzyste, Daszyńskiego, Dietla 80, 82, 86, 88, 90, Dwernickiego, Grzegórzeckiej nry parzyste 2–42 i nieparzyste 1–51, Gurgacza, Kołłątaja, Kopernika, Kurkowej, Librowszczyzna, Lubicz oprócz 1–5, Lubomirskiego, św. Łazarza, Masarskiej do nru 13, Metalowców, Miodowej 53, 55, 56, Mogilskiej nry parzyste do 20, Morsztynowskiej, Olszańskiej 1–8, Podgórskiej 22–34, W.