8 września żołnierze niemieccy doszczętnie spalili Czekaj, mordując 19 mieszkańców.
Na Pomorzu Nadwiślańskim do jednej z największych pacyfikacji doszło 3 września w Świekatowie. Rozstrzelano tam w kilku egzekucjach 22 mieszkańców (według innych źródeł liczba ofiar wyniosła 26 osób). 8 września w piaskowni pod Książkami na ziemi chełmińskiej oddział SS rozstrzelał 43 Polaków. W Konecku koło Inowrocławia członkowie paramilitarnego Selbstschutzu, wspierani przez żołnierzy Wehrmachtu, zamordowali 9 i 12 września około 19 młodych mężczyzn z tej i sąsiednich miejscowości. 11 września w nadmorskiej Wielkiej Wsi rozstrzelano 25 osób.
Wehrmacht i inne niemieckie formacje dopuściły się licznych zbrodni także we wsiach na Górnym Śląsku. Między innymi, 1–2 września w Gostyniu Wehrmacht rozstrzelał 14 mieszkańców. W Łaziskach Dolnych, Górnych i Średnich, w odwecie za opór stawiany przez żołnierzy Wojska Polskiego, rozstrzelano 2 września blisko 48 osób. Spalono również osiem budynków. 3–4 września w Imielinie żołnierze Wehrmachtu rozstrzelali 21 mieszkańców i 8 uchodźców. 4 września w Orzeszu członkowie Freikorps Ebbinghaus rozstrzelali 29 osób.