W 1982 r. młodszy z synów, student medycyny, zginął tragicznie w wypadku samochodowym. Wacław Kowalski bardzo to przeżył. Wycofał się z aktorstwa. Jego rezygnacja z roli w serialu Dom była jedną z głównych przyczyn zakończenia realizacji serialu w latach 80. i uśmiercenia postaci Ryszarda Popiołka. Kowalski już nigdy nie pojawił się na ekranie, konsekwentnie odrzucał wszystkie propozycje. Ostatnie lata życia spędził w swoim domu w Brwinowie nieopodal Warszawy, w którym zmarł nagle 27 października 1990, w wyniku udaru mózgu. Jest pochowany na cmentarzu parafialnym w Brwinowie wraz z żoną i synem.
Filmografia 25px Filmy fabularne Rok Tytuł Reżyser Rola 1946 Zakazane piosenki Leonard Buczkowski śpiewak z gitarą 1953 Żołnierz zwycięstwa Wanda Jakubowska żołnierz hiszpański 1953 Trudna miłość Stanisław Różewicz Kubala 1953 Przygoda na Mariensztacie Leonard Buczkowski murarz Stefan Wachowiak 1954 Pod gwiazdą frygijską Jerzy Kawalerowicz członek partii 1954 Autobus odjeżdża 6.20 Jan Rybkowski woźny w biurze Poradzkiego 1955 Trzy starty Ewa Petelska, Czesław Petelski kolejarz na zabawie 1956 Ziemia Jerzy Zarzycki Banach 1956 Szkice węglem Antoni Bohdziewicz chłop z Baraniej Głowy 1957 Pętla Wojciech Jerzy Has taksówkarz Kostek, szwagier dozorcy 1957 Ewa chce spać Tadeusz Chmielewski rusznikarz w 8-ym komisariacie 1958 Wolne miasto