Wiązało się to także z innymi poglądami na kwestię Tysiącletniego Królestwa, powrotu Izraela do Ziemi Obiecanej i ważności wszystkich świąt biblijnych. Trudności te pokonano w latach 1938/1939 odwołując się do tolerancji i autonomii. Zbory podjęły współpracę, a społeczność się rozwijała aż do wybuchu we wrześniu II wojny światowej. W okresie przedwojennym społeczność była zaledwie tolerowana. W czasie wojny natomiast niektórych dotknęły wysiedlenia, roboty przymusowe czy uwięzienie. Po wojnie w miał miejsce I Zjazd Krajowy dając podwaliny obecnej organizacji.
Kościół Chrześcijan Dnia Sobotniego W 1961 roku nastąpiła zmiana nazwy na obecną i regulacja prawna Kościoła w PRL na podstawie prawa o stowarzyszeniach. Od roku 1977 siedziba Kościoła znajduje się w Bielsku-Białej. W roku 1984 Kościół przystąpił do Światowej Federacji Baptystów Dnia Siódmego. W roku 1989 zbór w Brennej wraz z kilkoma innymi, dążąc do przywrócenia autonomii na bazie której wyrosła ta społeczność w latach 30. XX wieku, odłączyły się od KChDS tworząc nową społeczność o nazwie Zbory Boże Chrześcijan Dnia Siódmego.