Dwa razy tylko do roku, to jest w dzień Znalezienia i Podwyższenia świętego Krzyża odbywa się tutaj nabożeństwo. Wtenczas z dalekich stron napływa mnóstwo ludu i serdeczną, gorącą modlitwą wynagradza niejako to opuszczenie, w jakiém zostaje ten starodawny kościółek z powodu osamotnionego położenia (...). Nie ma w nim nic osobliwego; ubogi, zaniedbany, w wielkim tylko ołtarzu jest wcale piękny obraz ukrzyżowanego Chrystusa.
W 1928 Krakowski Klub Automobilowy postanowił otoczyć opieką kościół w Obidowej. Począwszy od 1965 roku kościołem opiekuje się Zgromadzenie Księży Marianów w Rdzawce. 2 października 1994 budynek został podpalony przez nieznanych sprawców. Uratowany został tylko dzięki szczęśliwemu zbiegowi okoliczności: akurat Zakopianką wracała specjalistyczna jednostka Straży Pożarnej z Krakowa. Dzięki błyskawicznej akcji udało się kościół uratować, spłonęła tylko jedna ściana z zabytkową rzeźbą Ukrzyżowania. Wkrótce dzięki ofiarności miejscowej społeczności kościół został odbudowany.