miejscu w głosowaniu fanów na 100 najlepszych albumów wszech czasów magazynu Q.
Absolution (2003–2005) mały|Chris Wolstenholme występujący w Mod Club Theatre, Toronto w 2004 roku; międzynarodowa trasa promująca Absolution zawierała pierwsze występy zespołu w Ameryce Północnej od 1999 roku|lewo
W 2003 roku został wydany trzeci album studyjny, Absolution. Krążek wyprodukowany przez Richa Costeya (wcześniejszego producenta Rage Against the Machine) demonstrował kontynuację eksperymentów z Origin of Symmetry, utrzymując trzyczęściową formę utworów. Album został zbudowany wkoło tematu końca świata i reakcji w związku z tą sytuacją. Pomimo tego grupa opisuje go jako „podnoszący na duchu”, z pozytywnym przesłaniem płynących z piosenek takich jak „Blackout” i „Butterflies and Hurricanes”. Apokaliptyczny temat albumu wziął się z zainteresowań Bellamy’ego teoriami konspiracyjnymi, teologią, nauką oraz siłami nadprzyrodzonymi. Piosenka „Ruled By Secrecy” wzięła tytuł z noweli Jima Marrsa Oni rządzą światem (w oryginale Rule by Secrecy), która opowiada o spiskach będących udziałem większości rządów.