Wkrótce, wraz z rozwojem Federacji Młodzieży Walczącej, Grupy Wykonawcze FMW objęły swoim działaniem cały kraj. Na początku 1986 roku w podwarszawskich Łomiankach Solidarność Walcząca (podziemna komórka Oddziału Warszawskiego SW) powołała swoje Grupy Wykonawcze Solidarności Walczącej.
Działania organów ścigania PRL wymierzone w FMW Po raz pierwszy organy ścigania PRL zainteresowały się Federacją Młodzieży Walczącej jeszcze pod koniec 1984 r. Wydział III SUSW (Warszawa) podjął wówczas czynności zmierzające do rozpracowania organizacji w ramach Sprawy Operacyjnego Sprawdzenia „Łączność”Pismo SUSW Warszawa do WUSW Gdańsk. Akta Operacji „Federacja”. IPN Gdańsk.. Analogiczne działania podjął w grudniu 1984 r., po kolportażu na terenie IX LO w Gdańsku ulotek sygnowanych przez Federację Młodzieży Walczącej IX LO Wydział III WUSW w Gdańsku w ramach Sprawy Operacyjnego Rozpoznania „Federacja”. W pierwszej połowie 1985 r. Federacja Młodzieży Walczącej znalazła się pod ścisłą obserwacją elitarnego Biura Studiów Służby Bezpieczeństwa. Świadczą o tym nieliczne zachowane w IPN materiały SBTeczka Osobowa J.Czarnecki.IPN Warszawa http://www.fmw.org.pl/index.php?option=18&action=articles_show&cat_id=150&art_id=563&menu_id=741&page=291. – większość najprawdopodobniej uległa zniszczeniu wraz z archiwum Biura Studiów SB.