Dzięki pomocy ze strony ocalonych Nimf oraz po ujarzmieniu władców wszystkich krain Rozdroża (zamienionych w monstra w wyniku opanowania przez koszmary) bohaterowie mogą zmierzyć się z osobą odpowiedzialną za zasianie chaosu – Małakiem o imieniu Magik.
Rozgrywka Rayman Origins jest komputerową grą platformową osadzoną w środowisku dwuwymiarowym, w której gracz pokonuje różnorodne przeszkody, nakazując swojemu awatarowi bieganie, skoki czy uderzanie przeciwników, zbieranie jak największej liczby świetlistych stworzeń nazywanych lumami i uwalnianie innych stworów – elektrunów. Zbieranie lumów określa odznaczenie przyznawane graczowi za przebycie etapu; uwalnianie elektrunów otwiera z kolei dostęp do kolejnych poziomów. Mimo że świat jest dwuwymiarowy, postacie mogą przeskakiwać w pewnych momentach do innych warstw ekranu.
Rayman Origins zawiera tryb dla jednego gracza oraz tryb wieloosobowy, w którym może wziąć udział do czterech uczestników. W trybie wieloosobowym gracze muszą ze sobą współpracować, by rozwiązać zagadki i znaleźć różnego rodzaju ukryte przedmioty. W przypadku odniesienia obrażeń postać gracza zamienia się w balon;