Zawartość taksonomiczna grupy Monstersauria jest względnie stabilna, jednak jej dokładna pozycja filogenetyczna znacząco różni się w zależności od analizy. Badania morfologiczne sugerują bliskie pokrewieństwo z waranowatymi, podczas gdy molekularne – z padalcowatymi i Carusioidea. Analiza łącząca cechy morfologiczne i molekularne, wykorzystująca jedynie współczesne taksony, wskazuje na bliższe pokrewieństwo z waranami, jednak dodanie do niej taksonów kopalnych (u których kodowane są wyłącznie cechy morfologiczne) zmienia pozycję Monstersauria na kladogramie na bliższą padalcowatym i Carusioidea. Niektórzy autorzy sugerują jednak, że taksony tradycyjnie zaliczane do Monstersauria nie tworzą monofiletycznej grupy: według analizy Yi i Norella (2010) Heloderma, Lowesaurus i Eurheloderma znajdują się w politomii z kladem Varaniformes (do którego według nich należy Estesia).