Rozgrywka Rozgrywkę w grze Apollo Justice: Ace Attorney można podzielić na dwa tryby: Badanie i Rozprawę Sądową. Obie są rozgrywane w stylu visual novel, więc fabuła jest bardzo liniowa, aczkolwiek podczas dialogów dla wielu kwestii jest przyporządkowane wiele tekstów, zależnych od sytuacji. Bohater ma pasek z energią. Gdy pokazuje niewłaściwą poszlakę danej osobie, jego energia spada. Ponieważ gra została stworzona specjalnie na konsolę Nintendo DS, wiele rzeczy robi się przez jej ekran dotykowy, lub mikrofon.
Gracz porusza się po różnych lokacjach, rozmawia z osobami zaangażowanymi w daną sprawę, bada różne przedmioty i miejsca, oraz prezentuje dowody. Wszystkie informacje zdobyte podczas trybu Badania gracz może wykorzystać podczas rozprawy. Tryb rozprawy sądowej bardzo przypomina rozgrywkę z poprzednich gier w serii. Gracz przesłuchuje świadków, zadaje im pytania, prezentuje dowody. Celem gracza jest wybronienie swojego klienta przed wyrokiem.