Beck, "Das Gymnasium zu Posen in Südpreussischen Zeit (1793-1807)", w: „Zeitschrift der hist. Gesellschaft für die Provinz Posen”, nr 2(1886), s. 343-378..
XIX i XX wiek Począwszy od 1802 r. placówkę zaczęto dostosowywać do standardów szkolnictwa pruskiego, zgodnie z reskryptem z kwietnia 1799 r.M. Przybecki, „Z dziejów staro-klasycznego gimnazjum św. Marii Magdaleny w Poznaniu”, Poznań, 1990, s. 7-9. Na temat reskryptu z 1799 r. por. Wanda Bobkowska „Pruska polityka szkolna na ziemiach polskich w latach 1793-1815”, Warszawa 1948, s. 68.. W 1828 r. miał tu gościć Fryderyk Chopin, który koncertował w byłym Kolegium jezuickim (dzisiejszym Urzędzie Miasta Poznania). W 1834 r. szkołę podzielono na dwa gimnazja – gimnazjum Fryderyka Wilhelma dla protestantów (dzisiejsze III Liceum Ogólnokształcące im. św. Jana Kantego w Poznaniu) i gimnazjum św. Marii Magdaleny dla katolików. Tym samym otrzymała ona nazwę, nawiązującą do nieistniejącej już kolegiaty pod wezwaniem Marii Magdaleny lub do współczesnej pojezuickiej kolegiaty z tą samą patronką. W następstwie nieudanego ataku na poznańską cytadelę w 1846 r. i uwięzienia uczniów gimnazjum, należących do spisku, uległy wobec władzy pruskiej rektor gimnazjum ks. Jakub Prabucki wydał nakaz nauczycielom, by przeprowadzili rewizję w prywatnych mieszkaniach uczniowskichZ. Boras, op.cit., s.