Wkrótce po ogłoszeniu warunków porozumienia i konieczności dymisji premiera, w Mogadiszu doszło do kilkudniowych protestów społecznych sprzeciwiających się jego ustąpieniu. Protestujący określali go mianem „jedynego uczciwego polityka w rządzie” i podkreślali, że jego gabinet podjął skuteczną walkę z bojownikami islamskimi z Asz-Szabab oraz jako jedyny rozpoczął walkę z korupcją i zapewnił regularną wypłatę żołdu. 11 czerwca 2011 premier Mohamed odmówił odejścia ze stanowiska i zażądał przedłożenia porozumienia z Kampali do akceptacji parlamentu. Stwierdził, że decyzja o jego dymisji znajduje się kompetencji parlamentu i ustąpi wyłącznie po przyjęciu przez izbę tegoż porozumienia.

19 czerwca 2011, pomimo wcześniejszego stanowiska, premier ogłosił jednak swoją dymisję. Stwierdził, że zdecydował się na taki krok, „mając na uwadze interes narodu somalijskiego i aktualną sytuację w Somalii”. Obowiązki szefa rządu, do czasu powołania nowego szefa rządu, przejął wicepremier Abdiweli Mohamed Ali. Został on w kolejnych dniach mianowany przez prezydenta nowym premierem, a 28 czerwca 2011 jego kandydaturę zatwierdził parlament.