Prezydent Somalii Mohamed Abdullahi Mohamed wziął po raz pierwszy udział w wyborach prezydenckich 10 września 2012. Był jednym z ponad 20 kandydatów i odpadł w pierwszej turze głosowania, zajmując siódme miejsce i zdobywając 14 z 271 głosów. Prezydent, którym został wówczas Hassan Sheikh Mohamud, był wybierany w sposób pośredni, przez członków nowo ukonstytuowanego parlamentu.
Po raz drugi wziął udział w wyborach prezydenckich 8 lutego 2017. Wybory prezydenckie, które początkowo miały odbyć się w listopadzie 2016, zostały przełożone o kilka miesięcy. Odbyły się po wyborach parlamentarnych z października i listopada 2016, w których 14 tysięcy wyborców należących do starszyzny plemiennej wybierało 275 członków Izby Niższej i 52 członków Izby Wyższej Federalnego Parlamentu Somalii, którzy z kolei byli uprawnieni do wyboru prezydenta.
Wybory, w których uczestniczyło 21 kandydatów, odbyły się w budynkach portu lotniczego w Mogadiszu chronionych przez międzynarodowe wojska Unii Afrykańskiej z powodu zagrożenia ze strony bojowników Asz-Szabab. W pierwszej turze głosowania Mohamed Abdullahi Mohamed zajął drugie miejsce, przegrywając z urzędującym prezydentem Hassanem Sheikhiem Mohamudem.