W grze jest do zdobycia 6 zakończeń, w tym jedno bonusowe, dostępne za drugim podejściem: Forgiveness: nie zabijać Anne i zdobyć pozytywne morale. Truth and Justice: nie zabijać Anne i zebrać negatywne morale. Full Circle: zabić Anne i zdobyć pozytywne morale. Execution: zabić Anne i zebrać negatywne morale. Reversal: należy pozwolić Anne zabić Murphy'ego w walce. Surprise!: ukończyć grę raz i podczas następnej gry przejść quest Digging Up the Past.

Rozgrywka Rozgrywka Downpour opiera się przede wszystkim na rozwiązywaniu zagadek, których powraca wybór poziomu trudności. Widok postaci będzie całą grę z trzeciej perspektywy. Gra zawiera również w sobie elementy sandboxu, w tym dodatkowe questy i zadania poboczne, w większości niemające znaczenia dla głównej rozgrywki. Główny bohater będzie w stanie posiadać tylko jedną broń (tak jak w dodatkowym trybie w Silent Hill 4: The Room), która dodatkowo będzie mogła się zniszczyć. Ubrania Murphy'ego wskazują na poziom zdrowia bohatera (im bardziej zakrwawione, bym gorzej z jego poziomem życia). W Downpour zawarto także system wyborów, które między innymi mogą mieć wpływ na zakończenie gry.