Na przełomie 1946 i 1947 roku „Van Kinsbergen” został ponownie przystosowany do roli okrętu szkolnego. Przebudowę przeprowadziła jego macierzysta stocznia w Rotterdamie. Przebudowano nadbudówki i komin, wymieniono maszt główny, zaś w miejsce dotychczasowych dział kal. 120 mm zamontowano dwa działa uniwersalne kal. 105 mm produkcji niemieckiej, pozyskane z umocnień Wału Atlantyckiego. Niewielkim zmianom poddano również uzbrojenie małokalibrowe i przeciwpodwodne.
Przebieg służby II wojna światowa thumb|„Van Kinsbergen” na początku służby thumb| „Van Kinsbergen” w kamuflażu w październiku 1944 roku thumb|„Van Kinsbergen” w 1948 roku Hr.Ms. „Van Kinsbergen” wypłynął z Den Helder 2 października 1939 roku, kierując się do holenderskich posiadłości w Indiach Zachodnich. W rejsie towarzyszyły mu okręty podwodne O 14 i O 20. 31 października zespół dotarł do Curaçao. W związku z deklarowaną przez Holandię neutralnością w toczącej się od 1 września wojnie, okręt kilkakrotnie zmuszony był do interwencji w przypadkach naruszania granicy wód terytorialnych przez jednostki brytyjskie.