Klimat Saint Pierre i Miquelon cechuje się niekorzystnymi warunkami atmosferycznymi i biometeorologicznymi.
Temperatury są łagodne, ale niskie, średnia roczna temperatury wynosi około +6 °C (+3 °C w nocy i +8 °C za dnia). Średnie temperatury zimowe wynoszą około −1 °C (odpowiednio: −5 °C i 0 °C), natomiast latem jest chłodno, średnie wartości wynoszą około 15 °C (12 °C i 18 °C). Amplitudy dobowe są niewielkie i na ogół nie przekraczają 5 °C. Poziom nasłonecznienia jest niewielki, co wiąże się nie tylko z szerokością geograficzna, ale i zachmurzeniem, które ma też wpływ na temperatury.
Opady są wysokie, związane z działalnością oceanicznych mas powietrza. Opady deszczu są częste, a roczne wartości wynoszą 1500 mm, a nawet więcej. Zima trwa około 4 miesięcy, co wiąże się także z opadami śniegu. Wysoka wilgotność powietrza wywołuje częste mgły, a efektem tego są niekorzystne warunki biometeorologiczne i ogólnie atmosferyczne.
thumb|320px|Krajobraz zimowy wysp
Wody Wyspy są zasobne w wody, które występują głównie w postaci licznych jezior, zarówno lagunowych, jak i polodowcowych. Sieć rzeczna jest uboga – ma postać krótkich strumieni. Na wyspach znajdują się także tereny podmokłe.