Wewnątrz ministerstwa obrony najwyższy rangą oficer odpowiedzialny jest za produkcję obronną, infrastrukturę, budżet, a pomimo to minister może interweniować we wszystkie dziedziny działalności armii. Wszyscy oficerowie na stanowiskach dowódczych w Sztabie Generalnym posiadają stopnie wojskowe generała-majora (alluf).
Sztab Główny Sił Obronnych Izraela składa się z (podano dane osobowe z 2019): Dowództwo: Szef Sztabu Generalnego Sił Obronnych Izraela – generał porucznik Herci Halewi Zastępca Szefa Sztabu Generalnego Sił Obronnych Izraela – generał major Ejal Zamir Dowódcy Broni: Dowódca Sztabu Sił Lądowych – generał major Jo’el Strick Dowódca Sił Powietrznych – generał major Amikam Norkin Dowódca Marynarki – wiceadmirał Eli Szarwit Oddziały: Szef Zarządzania Operacyjnego – generał major Aharon Chaliwa Szef Wywiadu – generał major Tamir Hajman Szef Zarządzania Technologii i Logistyki – generał major Jicchak Turdżeman Szef Dyrekcji Zasobów Ludzkich – generał major Moti Almoz Szef Planowania – generał major Tomer Bar Szef Zarządzania Usługami Komputerowymi – generał major Li’or Karmeli Szef Zarządzania Strategii i Trzeciego Koła – generał major Tal Kalman Dowództwa terytorialne: Szef Dowództwa Północnego – generał major Amir Baram Szef Dowództwa Centralnego – generał major Tamir Jadaj Szef Dowództwa