Po powrocie do zdrowia kontynuował służbę w Szanghaju i Nankinie. Do 1949, dzięki wspólnej posłudze ewangelizacyjnej Watchmana Nee, Witnessa Lee i innych współpracowników, w ponad 30 prowincjach chińskich powstało przeszło 400 kościołów miejscowych. W kolejnych kilku latach, mimo ograniczeń nakładanych przez komunistów, ruch zanotował szybki przyrost liczebnyWedług niektórych statystyk ruch »Małego Stadka« [tak nazywano w Chinach zgromadzenia utożsamiane z posługą Watchmana Nee] w samej tylko prowincji Zhejiang liczył w 1957 r. 362 zbory i skupiał ok. 36 tys. członków. Uważa się, że obejmował swoim zasięgiem 15-20% wszystkich chrześcijan w Chinach – M. Kwiecień, Watchman Nee. Biografia, Wydawnictwo Arka, Cieszyn 1999, s. 92. – http://swch.pl/biografie/nee.html.
Witnessowi Lee przypisuje się wprowadzenie w Chinach nowej metody ewangelizacji – tzw. osadnictwa misyjnego, polegającego na tworzeniu nowych zgromadzeń za pośrednictwem całych grup rodzin, które przeprowadzały się na tereny objęte pracą ewangelizacyjnąTamże, s. 84-85. [Osadnictwo misyjne – http://swch.pl/biografie/nee.html]. Ze zdobytych doświadczeń korzystał później także na Tajwanie i w Stanach Zjednoczonych.