Przeciwnicy zarówno na mapie kampanii, jak i na polu bitwy odznaczają się bystrością, zastawiając pułapki, przewidując zamiary gracza czy też prowadząc skuteczną politykę.
Religie W grze Total War: Shogun 2 początkowo w całej Japonii kwitnie buddyzm, będący jej narodową religią. Ta religia daje możliwość rozbudowy świątyń buddyjskich, w których można rekrutować jedną z najlepszych jednostek w grze, jaką jest Mnich Wojownik.
Jednak wraz z przybyciem europejskich handlarzy dociera do Japonii chrześcijaństwo. Ta religia może wprowadzić zamieszanie w niektórych prowincjach, szczególnie w tych, gdzie obecne są porty handlujące z Europą. Przejście na tę wiarę daje dostęp do broni palnej, a po budowie sześciu kościołów możliwe jest wzniesienie katedry.
Klan Ikko-Ikki (dostępny jako DLC w sklepie serwisu Steam) wyznaje religię Jōdo-shinshū, która jest bardzo radykalną odmianą buddyzmu.
Zmiana wyznania w państwie często jest dużym wyzwaniem, wiążącym się z konsekwencjami. Obywatelom zmiana religii na inną na pewno się nie spodoba (może nawet dojść do buntu) a cały proces nawracania trwa kilka lat.