Nakazywały również przejmowanie akt polskich urzędów, zajmowanie i zabezpieczanie zakładów przemysłowych oraz konfiskatę wartościowych przedmiotów i surowców. Einsatzgruppen miały ponadto zabezpieczyć przyszłą linię demarkacyjną między ZSRR a III Rzeszą.
Nie można wykluczyć, że jeszcze przed rozpoczęciem wojny Einsatzgruppen otrzymały ustny rozkaz rozstrzeliwania przedstawicieli tzw. polskiej warstwy przywódczej. Autorzy monografii Einsatzgruppen w Polsce przypuszczają jednak, że niemieckie plany początkowo nie zakładały bezpośredniej eksterminacji polskiej inteligencji. Między innymi, z datowanych na 29 sierpnia 1939 roku zapisów w dzienniku gen. Franza Haldera wynika, że zadaniem Einsatzgruppen miało być aresztowanie najpierw 10 tys., a następnie 20 tys. osób, a następnie wywiezienie ich do obozów koncentracyjnych. Niemniej nazistowska polityka szybko uległa radykalizacji. Zachowane wypowiedzi najwyższych dowódców SS i Wehrmachtu wskazują, że już w pierwszej połowie września 1939 roku Adolf Hitler wydał rozkaz fizycznej eksterminacji polskiej arystokracji, inteligencji i duchowieństwa.