W 2012 i 2013 roku dochodził z Santos Laguną do finału Ligi Mistrzów CONCACAF, za każdym razem przegrywając w nim jednak ze swoją byłą drużyną – CF Monterrey.
13 maja 2014 ogłoszono, że od nowego sezonu Peralta będzie zawodnikiem czołowego meksykańskiego zespołu Club América ze stołecznego miasta Meksyk, podpisując z nim trzyletni kontrakt – w zamian Santos Laguna otrzymała 5 milionów dolarów oraz kartę zawodniczą Adriána Aldrete. Z roczną pensją 2,5 miliona dolarów został najlepiej opłacanym piłkarzem w historii ligi meksykańskiej. Już w jesiennym sezonie Apertura 2014 jako podstawowy piłkarz Amériki zdobył trzecie w swojej karierze mistrzostwo Meksyku. W 2015 roku zajął drugie miejsce w krajowym superpucharze – Campeón de Campeones, triumfował w najbardziej prestiżowych rozgrywkach Ameryki Północnej – Lidze Mistrzów CONCACAF, a także wziął udział w Klubowych Mistrzostwach Świata, podczas których strzelił gola w ćwierćfinale z Guangzhou Evergrande (1:2), natomiast América uplasowała się na piątej pozycji. W 2016 po raz drugi z rzędu triumfował ze swoją ekipą w północnoamerykańskiej Lidze Mistrzów.