W styczniu 2009 Peralta został wypożyczony na rok do klubu Jaguares de Chiapas z siedzibą w Tuxtla Gutiérrez. Podczas sezonów Clausura 2009 i Apertura 2009 rozegrał łącznie 35 meczów, zdobywając 12 goli.
Po powrocie do Santos Laguny 26-letni piłkarz wywalczył z drużyną dwa wicemistrzostwa z rzędu (sezony Bicentenario 2010 i Apertura 2010). O ile w pierwszych z wymienionych rozgrywek Peralta był podstawowym zawodnikiem zespołu (prowadzonego przez byłego szkoleniowca Peralty z Morelii, Rubéna Omara Romano), to podczas Apertury był jedynie rezerwowym dla Christiana Beníteza, który powrócił do Torreónu z wypożyczenia do Birmingham City. Latem 2011, po odejściu Ekwadorczyka, wywalczył sobie miejsce w wyjściowej jedenastce i został jednym z najlepszych napastników w Meksyku. W wiosennym sezonie Clausura 2012 zdobył ze swoim klubem mistrzostwo Meksyku, a także został odznaczony dwoma nagrodami w plebiscycie Meksykańskiego Związku Piłki Nożnej – dla najlepszego piłkarza i napastnika w lidze meksykańskiej.