Howlett zdobył doświadczenie w grupie Cut 2 Kill, w której występował jako drugi DJ.
Po konflikcie wewnątrz grupy Liam Howlett odszedł i postanowił rozpocząć karierę solową. W krótkim czasie nagrał swoją pierwszą kasetę demo, którą zaprezentował Thornhillowi i Flintowi. Zaproponowali oni wspólne występy: Howlett jako muzyk a Flint i Thornhill jako tancerze. Howlett przystał na tę propozycję, dając tym samym początek The Prodigy.
Pierwszym menedżerem zespołu został Ziggy, znajomy Howletta. Zaproponował on, by do grupy dołączył MC. Uzyskawszy aprobatę zespołu, Ziggy znalazł Keitha Palmera, lepiej znanego jako Maxim Reality, który stał się pełnoprawnym członkiem grupy. Przez pewien czas z grupą występowała tancerka Sharky, która ostatecznie jednak opuściła zespół. Grupa wystąpiła po raz pierwszy w Boże Narodzenie 1990 roku w londyńskim klubie The Labyrinth, a w styczniu 1991 w Wielkiej Brytanii ukazał się ich pierwszy EP „What Evil Lurks”. Dopiero jednak singiel „Charly” spowodował, że zespół stał się znany na brytyjskiej scenie rave.