Ostatecznie, wobec przeciągania się sprawy przydziału, 4 maja 1948 minister ziem odzyskanych poinformował wojewodę o decyzji, na mocy której kościół ewangelicki przyznał katolikom, kościół katolicki – ewangelikom, a Grenzmuzeum – Stronnictwu Ludowemu.
Na przełomie 1947 i 1948 parafia ewangelicka w Nidzicy skupiała około 900 wiernych.
4 sierpnia 1948 Kierownik Oddziału Nieruchomości wraz z rzymskokatolickim ks. Hardybałą oraz ewangelickim ks. Alfredem Jaguckim dokonali oględzin i pomiarów budynków obu kościołów. Katolikom pozostawiono cały kościół ewangelicki wraz z wyposażeniem, za zgodą obecnej strony ewangelickiej. Dodatkowo katolikom pozwolono zabrać z ich dotychczasowego kościoła ołtarze boczne, relikwie, stacje drogi krzyżowej, sygnaturkę, konfesjonał i katafalk. Luteranom pozostawiono tu trzy dzwony, ołtarz główny, ławki, ambonę, kropielnicę, krucyfiks i zniszczone organy.