Parafia ewangelicka otrzymała nowy kościół w użytkowanie 10 sierpnia 1948. Pierwsze nabożeństwo odbyło się w nim 19 września tego samego roku. Ewangelicy nie mogli jednak wykorzystywać pomieszczeń dawnej katolickiej plebanii. W maju 1950 senior diecezji ks. Edmund Friszke informował, że miejscowy ewangelicki duszpasterz ks. Eugeniusz Jungto zajmował jedynie mały pokój na poddaszu tego budynku, gdyż pozostała część pozostawała zajęta przez emerytowanego katolickiego księdza Karnowskiego, niechcącego opuścić tej nieruchomości. Dodatkowo zajmujący plebanię duchowny katolicki sprowadził tam dwie dodatkowe lokatorki. Wobec spowodowanego tym faktem braku stosownego lokalu, nie było tu też kancelarii parafialnej. Pomieszczenia na parterze budynku zostały udostępnione ks. Jungto dopiero 10 listopada 1950.
Nidzicki proboszcz-administrator prowadził również posługi duszpasterskie w Działdowie, Gardynach, Koszelewach, Krokowie, Kozłowie, Lidzbarku, Łynie, Muszakach i Szczuplinach. Od czerwca 1953 dodatkowo administrował on parafiami w Mławie i Woli Mławskiej oraz filiałem w Ciechanowie. W 1954 ks. Jungto został przeniesiony do parafii w Tomaszowie Mazowieckim, w związku z czym administrację nad parafią w Nidzicy objął w czerwcu tego roku ks. Ryszard Małłek, w lipcu – ks.