Dzieje parafii w strukturach Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w RP Parafia działająca dotychczas w strukturach Ewangelickiego Kościoła Unii Staropruskiej zakończyła funkcjonowanie. Wierni pozostawali pozbawieni opieki duszpasterskiej. W listopadzie 1945 do miasta przybył ks. Jerzy Sachs z Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w RP. W momencie jego przyjazdu kościół w Szczytnie pozostawał otwarty. Wnętrze obiektu było brudne, ołtarz było ogołocony z wyposażenia, lichtarze połamano, a krzyż przewrócony był na podłogę. Pomiędzy ołtarzem a ławkami dla wiernych umieszczony był stół, zza którego kazania wygłaszał gromadkarz Bogumił Kompa. Ksiądz Sachs po skontaktowaniu się z Kompą poprowadził pierwsze nabożeństwo. W grudniu 1945 w mieszkaniu prywatnym Fryderyka Leyki miało miejsce zebranie konstytucyjne Rady Parafialnej. Ksiądz Jerzy Sachs opuścił następnie miasto na trzy dni w celu przywiezienia do kościoła w Szczytnie nakrycia na ołtarz, książek, materiałów biurowych, wina komunijnego i innego niezbędnego wyposażenia. Początkowo zamieszkał on w Szczytnie w mieszkaniu członkini parafii o nazwisku Romanowska. W nabożeństwach początkowo uczestniczyło kilkunastu wiernych, co spowodowane było panującym zimnem, brakiem odzieży, zniszczeniami domów oraz złymi nastrojami pośród członków wspólnoty.