Uczestniczył w życiu Poznania i Starołęki nie tylko swoją osobą, ale i majątkiem, wspierając organizacje, w których działał i inicjatywy współobywateli. Jedną z najważniejszych była sprawa wybudowania nowego kościoła, którego brak rosnąca społeczność starołęcka odczuwała coraz dotkliwiej. Z jednej strony odległość od położonego na drugim brzegu Warty kościoła parafialnego w Głuszynie i wynikające z tego położenia trudności komunikacyjne, a z drugiej ograniczone możliwości parafii Głuszyńskiej w sprawowaniu opieki duszpasterskiej nad stale rosnącą liczbą parafian skłoniły ówczesnego proboszcza ks. prałata Antoniego Stychla do rozpoczęcia starań o postawienie w obrębie Starołęki odrębnego kościoła i utworzenie nowej parafii. Punktem zwrotnym w procesie realizacji tego zamiaru była decyzja Jana Paczkowskiego o przekazaniu na ten cel zakupionego przez siebie terenu. Jako znakomity przedsiębiorca i zarządca Paczkowski, chcąc zobligować wszystkie zainteresowane strony do maksymalnego wysiłku na rzecz postawienia kościoła, zakreślił ostateczny termin rozpoczęcia budowy, po którym, jeśli nie zostanie przynajmniej wmurowany kamień węgielny, przekazany teren stanie się na powrót jego własnością. Podobne warunki postawiły władze gminy mające budowę współfinansować.