28 maja 2011 pobił należący od Ricky’ego Hendersona New York Yankees rekord w liczbie skradzionych baz. W meczu New York Yankees z Seattle Mariners skradł swoją 327. bazę. Dwa tygodnie później, 13 czerwca, Jeterowi odezwała się kontuzja łydki i znalazł się na piętnastodniowej liście kontuzjowanych, będącej dopiero piątym takim momentem począwszy od sezonu 2003. Drużyna prowadziła 14–4 podczas nieobecności Jetera, na którego oddawany głosy aby rozpoczął Mecz Gwiazd 2011 jednakże do tego nie doszło. Zawodnik tłumaczył się, że potrzebuje odpoczynku od stresu emocjonalnego i fizycznego w związku z rekordowym, trzytysięcznym uderzeniem, które odbyło się 9 czerwca 2011.
Historyczne uderzenie nr 3000 thumb|Derek Jeter 9 czerwca 2011 uderzył piłkę po raz trzytysięczny zdobywając home run w trzecim inningu podczas wieczornej gry przeciwko Davidowi Price’owi, zawodnikowi Tampa Bay Rays. Jeter zakończył mecz z wynikiem 5/5 uderzeń, będąc drugim w historii zawodnikiem (po Craigu Biggio), który dokonał tego zdobywając jednocześnie 3000. uderzenie jako shortstop. Ostatnie z jego uderzeń tego dnia było uderzeniem kończącym spotkanie. Jest jak do tej pory jedynym zawodnikiem, który uzyskał wynik trzech tysięcy odbić grając dla jednej drużyny oraz drugim w historii (obok Wade’a Boggsa), który odbił piłkę po raz 3000.