Elis Flamur Bakaj (ur. 25 czerwca 1987 w Tiranie) – albański piłkarz grający na pozycji pomocnika, były reprezentant Albanii.
Kariera klubowa Bakaj jest rodowitym tirańczykiem. Karierę piłkarską rozpoczął w 1996 w klubie KF Kristali, skąd przeniósł się do Partizani Tirana, mając zaledwie 15 lat. W 2009 przeszedł do Dinamo Tirana i kolejne dwa sezony były najlepsze w jego karierze. W sezonie 2010/2011 razem z Emiljano Vilą i Nestorem Martineną tworzył najbardziej wartościowe trio w pierwszej lidze albańskiej.
W styczniu 2011 Bakaj został kupiony przez rumuński Dinamo Bukareszt za sumę 200 tys. euro. Klub rumuński poszukiwał w tym czasie bramkostrzelnego pomocnika, a najlepszą rekomendacją dla wyboru Albańczyka była kariera jego rodaka Sulejmana Demollariego, który w drużynie Dinama zdobył 36 bramek.