Franciszek Stanisław Junker (ur. 2 października 1893 w Zagórzu, zm. ?) – podpułkownik dyplomowany piechoty Wojska Polskiego, działacz niepodległościowy, kawaler Orderu Virtuti Militari.
Życiorys Syn Edwarda i Katarzyny z domu Kaperów. Uczył się w Przemyślu. Studiował dwa semestry na Uniwersytecie Franciszkańskim we Lwowie i dwa semestry w Akademii Górniczej w Przybramie. W latach 1911–1914 należał do Polskich Drużyn Strzeleckich.
W czasie I wojny światowej walczył w szeregach 3 pułku piechoty Legionów Polskich, a następnie II Korpusu Polskiego w RosjiPiotr Jakuboszczak, Szkolenie taktyczne ... s. 61.. Od 11 maja do 15 września 1918 był w niewoli niemieckiej.
Po odzyskaniu przez Polskę niepodległości 15 listopada 1918 wstąpił do Wojska Polskiego. 30 kwietnia 1921 otrzymał przeniesienie z Baonu Zapasowego 26 pp na stanowisko dowódcy Okręgowej Szkoły Podoficerskiej Nr III w Radomiu. 20 maja został zatwierdzony na tym stanowisku przez dowódcę Okręgu Generalnego „Kielce”.