Pod jego dowództwem, w latach 1944–1945, amerykańskie okręty podwodne osiągnęły swą największą efektywność w wojnie na Pacyfiku, a w dużej mierze dzięki niemu, amerykańska flota podwodna odcięła imperium japońskie od krytycznie niezbędnych dla japońskiego wysiłku wojennego źródeł zaopatrzenia w Azji Południowo-Wschodniej, zatapiając statki o łącznej pojemności ponad 5 mln ton, w tempie szybszym niż były je w stanie budować japońskie stocznie.
Z uwagi na wkład amerykańskiej floty podwodnej w pokonanie Japonii, 2 września 1945 roku admirał Lockwood towarzyszył admirałowi Nimitzowi na pokładzie pancernika USS „Missouri” (BB-63 podczas aktu kapitulacji Japonii. Za swoją wojenną służbę, wiceadmirał Charles Lockwood został odznaczony Legion of Merit oraz trzykrotnie Navy Distinguished Service Medal.