Muzycy na początku sierpnia 2006 ukończyli realizację zdjęć do teledysków do dwóch pierwszych piosenek: „Welcome to the Black Parade” i „Famous Last Words”, które wyreżyserował Sam Bayer. Gerard Way i Bob Bryar podczas zdjęć do drugiego z wideoklipów odnieśli kontuzje: Way zerwał sobie ścięgna w kostce, a Bryar poważnie poparzył sobie nogę (moment wypadku został uwieczniony w wersji teledysku przeznaczonej na rynek brytyjski), do której wdała się infekcja, przez co wymagał kontroli szpitalnej. Zespół w konsekwencji zdarzeń odwołał kilka koncertów. Album The Black Parade jest uważany za sukces zespołu, m.in. dotarł do Top 30 najlepszych albumów wg brytyjskiego magazynu „NME”. Od 22 lutego 2007 do 9 maja 2009 odbywali trasę koncertową The Black Parade World Tour. W międzyczasie grali z zespołami, takimi jak Rise Against, Thursday, Muse czy Billy Talent. Podczas trasy do członków grupy dołączył James Dewees, uzupełniając personel muzyczny o keyboard. The Black Parade plebiscycie magazynu „Kerrang!” został uznany za czwarty najlepszy album 2006 roku.