6 lutego 2020 odebrał od prezydenta RP Andrzeja Dudy akt powołania 7 lutego 2020 na drugą kadencję na zajmowanym dotychczas stanowisku na wniosek ministra obrony narodowej Mariusza Błaszczaka.. mały|alt=Dwaj generałowie w mundurach w kamuflażu wojskowym salutują podczas hymnu; w tle stoją cztery flagi: dwie biało-czerwone flagi Polski oraz dwie biało-czerwono-niebieskie flagi Stanów Zjednoczonych|gen. Jarosław Mika i gen. broni podczas uroczystości z okazji nadania nazwy wyróżniającej „Camp Kościuszko” poznańskim koszarom przy ul. Bukowskiej (30 lipca 2022) 10 marca 2020 Ministerstwo Obrony Narodowej poinformowało o wykryciu u generała koronawirusa SARS-CoV-2. Przebywał on wcześniej w Niemczech na naradzie wojskowej. Tym samym stał się jedną z pierwszych osób w Polsce z potwierdzonym zarażeniem wirusem. 16 grudnia 2020 w ambasadzie Republiki Federalnej Niemiec w Warszawie otrzymał Krzyż Honorowy Bundeswehry w Złocie, przyznany mu w uznaniu zasług na rzecz rozwoju polsko-niemieckiej współpracy wojskowej. Odznaczenie wręczył mu ambasador Arndt Freytag von Loringhoven. 6 lutego 2023 zakończył służbę wojskową, kończąc jednocześnie drugą kadencję Dowódcy Generalnego Rodzajów Sił Zbrojnych (jego następcą został gen.