1. Elementy cis Sekwencje, występujące zwykle w regionie regulatorowym UTR mRNA
1.A. Elementy cis występujące w regionie 5'UTR Sekwencja liderowa, której właściwości wynikają z I-, II- i III-rzędowej struktury RNA Eukariotyczne miejsce wiązania rybosomu sekwencję Shine Dalgarno – prokariotyczne miejsce wiązania rybosomu Miejsce inicjacji translacji (kodon AUG, sekwencje flankujące) wewnętrzne miejsce wiązania rybosomu (ang.: Internal Ribosome Entry Sites, IRES), umożliwiające translację niezależną od czapeczki 7mG Element odpowiadający na żelazo, (ang.: Iron Responsive Elements, IRE) Sekwencje rozpoznawane przez białka regulatorowe, wpływające na stabilność mRNA i translację
1.B. Elementy cis występujące w sekwencji kodującej
1.C.