W dwóch sezonach, które Brady rozpoczął w Michigan, osiągnął rekord 20 zwycięstw przy 5 porażkach. Jego drużyna zwyciężyła również w 1999 roku Citrus Bowl i w 2000 roku Orange Bowl. Brady zakończył grę w Michigan, zajmując trzecie miejsce w historii z 710 próbami podań i 442 udanymi podaniami, czwarte miejsce w łącznej długości podań z wynikiem 5,351 jardów i 62,3-procentową skutecznością podań oraz piąte miejsce z sumą 35 przyłożeń z jego podań.i. Ukończył studia na Uniwersytecie Michigan w grudniu 1999 roku z tytułem bakalaureata.
+Statystyki kariery uniwersyteckiejSezonZespółPodaniaGra dołem (rushing)UdanePróbySkuteczność podańDługość podańDługość/próbyPrzyłożeniaPrzechwyconePróbyZdobyte jardyZdobyte jardy/próbyPrzyłożenia1996Michigan Wolverines3560%265,201 - - - -1997Michigan Wolverines121580%1036,90054 -14 -701998Michigan Wolverines20032361,9%24277,514102 -105 -1,921999Michigan Wolverines18029561%22177,516634 -31 -0,91Kariera39563861,9%47737,5301790-150-1,73
Kariera w NFL Sezon 2000 W debiutanckim sezonie był dopiero trzecim rezerwowym rozgrywającym w składzie Patriots, bez większych szans na grę.