miejsce, tracąc niespełna pięć punktów do pierwszego Daisuke Takahashiego.
Kolejnymi zawodami były dla niego mistrzostwa kraju, podczas których po raz pierwszy w karierze wywalczył tytuł mistrza Japonii, wyprzedzając o pięć punktów drugiego Daisuke Takahashiego oraz o ponad 40 punktów, trzeciego Takahito Murę.
Podczas mistrzostw czterech kontynentów 2013 Hanyū był pierwszy po programie krótkim oraz trzeci po programie dowolnym, co ostatecznie dało mu drugie miejsce za Kevinem Reynoldsem.
Ostatnimi zawodami przedolimpijskiego sezonu były dla Hanyū mistrzostwa świata 2013, na których zajął 4. miejsce po tym, jak po upadku po poczwórnym toeloopie oraz braku wymaganej kombinacji po programie krótkim zajmował odległe 9. miejsce z notą niespełna 76 punktów.
Sezon 2013/2014: mistrzostwo olimpijskie i świata thumb|Hanyū (w środku) na podium igrzysk olimpijskich 2014 thumb|Hanyū (w środku) na podium mistrzostw świata 2014 wraz z Machidą (po lewej) i Fernándezem (po prawe)