5 lub 6 kwietnia 1940 został zamordowany w Kalininie (obecnie Twer) i pogrzebany potajemnie w jednej z bezimiennych mogił zbiorowych w Miednoje, gdzie od 2 września 2000 mieści się Polski Cmentarz Wojenny w Miednoje.
Był żonaty, miał dwoje dzieci.
5 października 2007 minister obrony narodowej Aleksander Szczygło mianował go pośmiertnie na stopień podpułkownikaDecyzja Nr 439/MON Ministra Obrony Narodowej z dnia 5 października 2007 w sprawie mianowania oficerów Wojska Polskiego zamordowanych w Katyniu, Charkowie i Twerze na kolejne stopnie oficerskie. Decyzja nie została ogłoszona w Dzienniku Urzędowym MON.. Awans został ogłoszony 9 listopada 2007 w Warszawie, w trakcie uroczystości „Katyń Pamiętamy – Uczcijmy Pamięć Bohaterów”.
23 kwietnia 2010 roku przy II Liceum Ogólnokształcącym im. Mikołaja Kopernika przy ul. Ułańskiej 2 w Łowiczu posadzono Dąb Pamięci o imieniu „Włodzimierz” poświęcony Włodzimierzowi Grabowskiemu katyn-pamietam.pl [dostęp 2012-04-03] oraz Uroczystość KATYŃ 1940 – 2010 – 23 kwietnia 2010 r. 2lolowicz.pl [dostęp 2012-04-03].