FastPCR – pakiet zintegrowanych narzędzi bioinformatycznych wykorzystywanych do projektowania starterów RNA, sond molekularnych oraz oligonukleotydów używanych do łączenia fragmentów DNA w metodzie . Program pozwala także na przeprowadzanie i analizę sekwencji, w tym ich dopasowania oraz wyszukiwanie różnych typów elementów repetytywnych.
Podstawowe cechy programu FastPCR jest przeznaczony do analizy sekwencji kwasów nukleinowych oraz projektowania starterów i sond molekularnych wykorzystywanych w szeregu technik biologii molekularnej. Dotyczy to różnych modyfikacji techniki PCR (, , , real-time PCR, (PCA)), jak i technik bazujących na sondach molekularnych, w tym w doświadczeniach z mikromacierzami oraz sond typu molecular beacon.
Sekwencja zaprojektowanych oligonukleotydów sprawdzana jest pod kątem temperatury topnienia oraz skłonności do tworzenia struktur drugorzędowych typu spinki do włosów, dimerów i G-kwadrupleksów. W przypadku dłuższych oligonukleotydów możliwe jest sprawdzenie złożoności językowej (ang. linguistic sequence complexity).