Z dorobkiem 35 punktów uplasowali się w tabeli na 14 miejscu (spadkowym). Ponadto w 1999 Spartakus zdobył puchar Polski na szczeblu okręgu – w finałowym spotkaniu, rozegranym 9 czerwca w Nowinach, pokonał 4:1 Wierną Małogoszcz. Rok później powtórzył ten sukces. W 1/2 finału zwyciężył po zaciętym meczu i serii rzutów karnych Błękitnych Kielce (1:1, k. 5:3), natomiast w decydującym o zdobyciu pucharu pojedynku wygrał 2:1 z Nidą Pińczów po dwóch golach strzelonych przez Gila.
W latach 1999–2007 Spartakus występował w IV lidze, rywalizował także w pucharze Polski na szczeblu centralnym. W sezonie 1999/2000 pokonał w pierwszej rundzie Pilicę Białobrzegi po dwóch golach Tomasza Bernata (2:1), natomiast w następnym meczu przegrał 1:2 z Hutnikiem Kraków. W kolejnych rozgrywkach Spartakus po zaciętym spotkaniu i serii rzutów karnych został wyeliminowany przez Raków Częstochowa (2:2, k. 4:5). W sezonie 2006/2007 zespół spadł do klasy okręgowej, przyczyniły się do tego problemy organizacyjno-finansowe. Przed rozpoczęciem kolejnych rozgrywek nastąpiła fuzja z Razem, w wyniku której powstał klub Spartakus Razem Daleszyce. Zespół przystąpił do rywalizacji w klasie okręgowej, w której należał do czołowych zespołów i ostatecznie zajął drugie miejsce, równoznaczne z grą w nowej IV lidze (piąty poziom ligowy) w sezonie 2008/2009.