Niedługo potem erygowano przy niej Parafię Podwyższenia Krzyża Świętego. Łącznie w wyniku działalności ks. Sondeja i współpracujących z nim kapłanów oraz wiernych na terenie jego parafii, wbrew oporowi ówczesnych władz administracyjnych, powstało 6 nowych punktów duszpasterskich. Później "na bazie" parafii ks. Sondeja utworzone zostały jeszcze parafie: Parafia Narodzenia Najświętszej Maryi Panny przy ul. Staroniwskiej (1979), Parafia Bożego Ciała Bożego Ciała i Matki Bożej z Lourdes przy ul. Zajęczej (1982) oraz Parafia Świętej Rodziny (1985).
Przez cały ten okres ks. Sondej był bardzo szykanowany przez władze komunistyczne, nękano go przesłuchaniami prokuratorskimi, rozprawami sądowymi i nakładanymi grzywnami. Był też intensywnie inwigilowany.
Ksiądz Sondej doceniał znaczenie pracy duszpasterskiej z młodzieżą akademicką, powołał Duszpasterstwo Akademickie (istnieje do dziś), zorganizował też Studium Katolickiej Nauki Społecznej Kościoła. Udzielał też potajemnie ślubów i chrzcił dzieci wierzących partyjnych.