Ksiądz Józef Sondej aktywnie wspierał opozycję polityczną w PRL, m.in. w lutym 1981 rolników z NSZZ „Solidarność” RI strajkujących w siedzibie byłej WRZZ (m.in. odprawiał msze święte i głosił homilie), w stanie wojennym w jego pierwszych dniach ukrywał w kościele działaczy ”Solidarności”, a następnie organizował pomoc duchową i materialną rodzinom osób internowanych, później udostępniał salę katechetyczną na spotkania działaczy odradzającego się niezależnego ruchu chłopskiego.
Od 1955 mieszkał przy Parafii Chrystusa Króla w Rzeszowie. W 1994 przeszedł na emeryturę.
17 listopada 2013 odsłonił Pomnik Żołnierzy Wyklętych w Rzeszowie.
Zmarł w sobotę 28 lutego 2015 o godz. 20.05 w Szpitalu Wojewódzkim nr 2 w Rzeszowie, w wigilię swoich 101. urodzin. 4 marca 2015 został pochowany na Cmentarzu Wilkowyja w Rzeszowie.
Odznaczenia, tytuły, wyróżnienia Postanowieniem prezydenta RP Lecha Kaczyńskiego z dnia 13 lutego 2008 został odznaczony Krzyżem Wielkim Orderu Odrodzenia Polski, za wybitne zasługi dla niepodległości Rzeczypospolitej Polskiej, za działalność na rzecz przemian demokratycznych, za kształtowanie moralnej i patriotycznej postawy młodzieży. Uroczystość wręczenia orderu miała miejsce w rzeszowskim Teatrze im.