Uniwersyteckie ośrodki dokumentacyjne i bibliograficzne Ośrodek Dokumentacji Życia i Twórczości Witolda Lutosławskiego Uniwersytetu Jagiellońskiego Ośrodek Dokumentacji Muzyki Polskiej XIX wieku im. I.J. Paderewskiego Uniwersytetu Jagiellońskiego (z tzw. dawnym działem muzycznym Muzeum Collegium Maius). Pracownia Dokumentacji Życia i Twórczości Heleny Modrzejewskiej Uniwersytetu Jagiellońskiego Centrum Badawcze Bibliografii Polskiej Estreicherów Uniwersytetu Jagiellońskiego Ośrodek Dokumentacji i Badania Twórczości Josepha Conrada Uniwersytetu Jagiellońskiego „Conradianum” Pracownia Dokumentacji Życia Literackiego okresu Młodej Polski Uniwersytetu Jagiellońskiego
Muzea Kościelne Muzeum Archidiecezjalne Muzeum Katedralne im. Jana Pawła II na Wawelu Muzeum Jana Pawła II w Krakowie w ramach Centrum Jana Pawła II „Nie lękajcie się” Muzeum Benedyktynów w Tyńcu Muzeum Historyczno-Misyjne Zgromadzenia Księży Misjonarzy w Krakowie Muzeum i Archiwum bł. Marii Angeli Truszkowskiej w Krakowie Muzeum Brata Alberta Chmielowskiego w Krakowie Muzeum Krakowskiej Prowincji Kapucynów Muzeum Klasztorne Ojców Dominikanów w Krakowie Muzeum Ojców Karmelitów w Krakowie na Piasku Muzeum Ojców Paulinów w Krakowie na Skałce Zbiory Archiwalno-Muzealne Krakowskiego Kościoła Garnizonowego św.