Wyjątek stanowił finał, w którym dodatkowy mecz przewidziano w przypadku odniesienia przez obie drużyny po jednym zwycięstwie, bez stosowania dodatkowych kryteriów. Na miejsce potencjalnego trzeciego meczu finałowego wyznaczono Budapeszt.
Losowanie wyłaniające drabinkę turniejową przeprowadzono podczas zebrania plenarnego Komisji Pucharu Europy, które odbyło się w dniach 4–5 listopada 1960 roku w Rio de Janeiro, w trakcie trwania mistrzostw świata. Cztery zespoły z federacji, których przedstawiciele dotarli do półfinału Pucharu Europy Mistrzów w 1960 roku, rozstawiono w drabince turniejowej tak, aby mogły trafić na siebie najwcześniej w półfinale, a finaliści poprzedniej edycji – dopiero w finale. Pozostałe zespoły zostały rozlosowane. Na podstawie prezentowanego poziomu sportowego część drużyn rozpoczęła udział w rozgrywkach od rundy kwalifikacyjnej, a pozostałe od 1/8 finału. Gospodarzem pierwszego meczu był co do zasady zespół wymieniony jako pierwszy w drabince turniejowej. Drużyny mogły jednak ustalić między sobą odwrotną kolejność rozgrywania spotkań.